大多数制药废水的特点是有机物浓度高，颜色深，难以降解并对微生物有毒，复杂的水成分和低生物降解性。废水中的抗生素残留和高水平的有机物使传统的生物处理难以达到理想的处理效果。由于残留抗生素对微生物的强抑制作用，需氧细菌被中毒，需氧处理变得困难。有机物很难达到排水标准，需要进一步处理。